Vaikka probioottien katsotaan olevan terveydelle hyödyllisiä, joillekin ihmisille näiden mikro-organismien ensimmäinen nauttiminen voi aiheuttaa erilaisia epämiellyttäviä oireita. Kun otetaan probiootteja ensimmäisen kerran, jotkut ihmiset voivat kokea oireita, kuten turvotusta, ripulia, päänsärkyä, kuumetta, lihaskipua, aivosumua ja mahdollisesti ahdistusta. Näiden oireiden uskotaan olevan reaktio kehossa tapahtuviin muutoksiin, kuten mahdollisten patogeenien häviämiseen tai suoliston vasteiden uudelleenaktivoitumiseen, ilmiötä, jota joskus kutsutaan "Herxheimer-reaktioksi".
Herxheimer-reaktio on ensimmäinen reaktio, joka yleensä osoittaa, että keho sopeutuu uuteen mikrobiympäristöön. Tämä voi johtua probioottien vuorovaikutuksesta olemassa olevan mikrobiyhteisön kanssa, mikä aiheuttaa bakteerien kuoleman tai metaboliittien vapautumisen, jotka laukaisevat nämä oireet. Vaikka tämä reaktio on epämiellyttävä, se on yleensä lyhytaikainen ja häviää nopeasti. Sitä voidaan pitää osana kehon homeostaasiprosessia.
Tämä koskee yleensä vain pientä määrää ihmisiä, ja oireet ovat lieviä ja kestävät yleensä vain muutamasta päivästä muutamaan viikkoon. Jos nämä oireet tekevät sinusta epämukavaa, voit pienentää annostasi tai lopettaa sen käytön muutamaksi päiväksi ennen kuin yrität uudelleen. jos nämä oireet jatkuvat yli muutaman viikon, lopeta sen käyttö; Jos sinulla on hengenahdistusta, kurkkukipua, nokkosihottumaa tai muita allergisen reaktion oireita, lopeta sen käyttö välittömästi. Sivuvaikutusten mahdollisuuden vähentämiseksi, erityisesti niille, joilla on herkkä ruoansulatusjärjestelmä, on viisasta aloittaa pienellä määrällä probiootteja ja lisätä sitten annosta muutaman viikon kuluessa.
Probioottien käytössä on oltava erityisen varovainen niille, joilla on vakavia immuunivajauksia, sillä harvinaisissa tapauksissa probioottien nauttiminen voi johtaa infektioon. Tämä johtuu siitä, että immuunijärjestelmä ei pysty tehokkaasti hallitsemaan mikro-organismien lisääntymistä kehossa, mikä aiheuttaa infektioriskin.
Joillakin ihmisillä voi olla allergisia reaktioita tietyntyyppisille probiooteille, erityisesti Saccharomyces boulardii -bakteeriin liittyville hiivoille. Muut probiootit, kuten laktobasillit, eivät yleensä aiheuta allergisia reaktioita.
Jotkut probiootit voivat tuottaa histamiinia ruoansulatuskanavassa. Liiallinen histamiinin vapautuminen voi aiheuttaa oireita, kuten kutinaa, lisääntynyttä kyynelten eritystä, nenän vuotamista, hengitysvaikeuksia, punoitusta ja turvotusta, erityisesti niille, joilla on histamiini-intoleranssi. Vältä näitä probioottisia kantoja epämukavuuden estämiseksi.