Probioottien vaikutukset eivät ole "yksi koko-sopii-kaikkiin" -, ne ovatkanta-erityinen. Tämä tarkoittaa, että jopa saman lajin sisällä eri kannoilla voi olla erilaisia tehtäviä ja terveyshyötyjä. Tietyt kannat esimerkiksi palauttavat tehokkaammin suoliston mikrobiottasapainon, kun taas toiset voivat paremmin lievittää laktoosi-intoleranssia tai tehostaa immuunitoimintaa. Siksi probioottisia tuotteita valittaessa ei riitä pelkkä sana "sisältää probiootteja". Kuluttajien tulee kiinnittää huomiotaerityisiä kantojasisältyvät tuotteeseen.
Lisäksi probioottien tehokkuus voi vaihdellaihmisestä ihmiseen. Tekijät, kuten yksilöllinen suoliston mikrobiston koostumus, ruokailutottumukset, elämäntapa, ikä ja yleinen terveydentila, vaikuttavat kaikki siihen, kuinka hyvin probiootit pystyvät kolonisoimaan suolistossa ja vaikuttamaan siihen. Esimerkiksi sama probioottikanta voi tuoda huomattavia parannuksia joillekin ihmisille, kun taas sillä on vähemmän vaikutusta toisiin. Tällainen vaihtelu on normaalia, eikä se välttämättä tarkoita, että tuote itsessään olisi tehoton.
Valmistajien pitäisi auttaa kuluttajia tekemään tietoisempia päätöksiämerkitse selvästi kannan nimi, kannan numero ja kohdekäyttäjäryhmätuotteen pakkauksessa ja ohjeissa sen sijaan, että käytät epämääräisiä termejä, kuten "maitohappobakteerit" tai "probiootit". Kuluttajien puolestaan tulisi valita tuotteet henkilökohtaisten terveystarpeidensa, kannan toiminnallisten ominaisuuksiensa ja valmistajan antamien tietojen perusteella. Tarvittaessa lääkärin tai ravitsemusasiantuntijan konsultointi voi myös tukea järkevämpiä valintoja.
Lyhyesti sanottuna probioottien ymmärtäminen tieteellisesti tarkoittaa sen väärinkäsityksen välttämistä, että "yksi kanta sopii kaikille". Tiettyjen kantatietojen tunteminen ja niiden sovittaminen yksilöllisiin tarpeisiin on avainasemassa probioottien todellisen terveyspotentiaalin vapauttamisessa.